公司业绩高速成长和中小板在沪深股市中的影响力提高，吸引了机构投资者的大量入驻。对比2006年和2005年的数据可以发现，各类机构投资者持有中小板公司股份的比重增加了近一倍。
据WIND统计，截止2006年12月31日，当时已经挂牌的107家中小板公司股份总额只有142.17亿股，其中的14.59亿股被基金、券商、券商理财产品、QFII、保险公司、社保基金、企业年金等7类机构投资者持有，占比高达10.26%。但在2005年，机构投资者持有中小板公司的股份只有股本总额的5.45%。具体的说，截止2005年12月31日，50家中小板公司的股本总额为56.14亿股，其中的3.06亿股被基金、券商、券商理财产品、QFII、保险公司、社保基金等6类机构投资者持有，当时没有发现企业年金的持股记录。
对中小板公司，基金是机构投资者中投资力度最大的群体。2006年底时，基金合计持有9.80亿股中小板公司股份，占机构投资者14.59亿股持股总量的67.17％。此外持股较多的机构投资者，分别是企业年金的1.47亿股、券商的4491万股和保险公司的3901万股。如果说基金持有中小板公司数量的大幅增加还与基金数量倍增有关的话，那企业年金投资规模前后迥异的巨大变化，多少从侧面证明了机构投资者2006年对中小板的青睐。
机构加大对中小板公司的投资力度，最好的理解是被它们的高成长特性所吸引。苏宁电器是2006年机构投资者持股数量最多的中小板公司，持股数量合计为2.28亿股，这比2005年的7750万股增加了194％。2006年，苏宁电器的主营业务收入同比增长率、主营业务利润同比增长率、净利润同比增长率分别高达56.42％、67.99％和105.43％，而2005年这三项的增幅分别是74.99％、74.40％和93.50％。其实，机构投资者持股数量排名靠前的中小板公司，几乎无不具有类似苏宁电器这样的高成长品质。
7类机构投资者持股中小板前20名公司
（截至2006年12月31日 单位：股）
名称 合计 基金 券商 券商理财产品 ＱＦＩＩ 保险公司 社保基金 企业年金
苏宁电器 ２２７，５４１，１８２．００ ２１８，６４７，５６３．００ １，１２０，８８６．００ ７，７７２，７３３．００ ８８９３６１９
大族激光 ８４，９７９，６６４．００ ５９，２７８，４５４．００ ２，９９６，２３１．００ ２９９６２３１
华兰生物 ７６，６５５，５５９．００ ４４，５８１，４７９．００
科华生物 ４２，１０８，５２９．００ ３５，５５１，９９７．００ ４，２０８，６７２．００ ２，３４７，８６０．００ ６５５６５３２
中捷股份 ３９，５７２，３２８．００ ３１，２４５，９４４．００ ６，０００，９４４．００ ６，０００，９４４．００
广州国光 ３７，８７５，０７８．００ ３７，８７５，０７８．００
黔源电力 ３５，９９５，９３９．００ １７，０７０，３４５．００ １，４９９，９８８．００ １，４９９，９８８．００
苏泊尔 ３４，８２１，３０４．００ ２９，９６１，０１８．００ ２，２５０，２８６．００ ２，６１０，０００．００ ４，８６０，２８６．００
宁波华翔 ３３，０４２，７４７．００ ３３，０４２，７４７．００
七匹狼 ２８，０２６，６４３．００ ２１，９２９，４２３．００ １，５１２，７８５．００ ２，５３６，９３５．００ ４０４９７２０
航天电器 ２５，５５６，２５３．００ １２，９４０，０００．００ ９２９，２５９．００ １，３７１，３８９．００ ２，３００，６４８．００
久联发展 ２３，９８７，６４０．００ １０，４１８，６０３．００ １，６２６，６２３．００ １，６８８，２８４．００ １，３９９，９４４．００ ４，７１４，８５１．００
思源电气 ２３，７９２，４９４．００ ２０，８２３，８８６．００
南京港 ２３，７４９，３３６．００ ３，８６９，４４８．００
华帝股份 ２２，９７２，９８５．００ １５，４８８，２８５．００ ８７８，１００．００ ８７８，１００．００
登海种业 ２１，１５１，６３３．００ ４，９４７，９３７．００
山东威达 ２０，０２０，７０７．００ ２，８３０，６５５．００
横店东磁 １８，９３０，２７７．００ １３，９２４，９３４．００ ４５０，０００．００ ４，５５５，３４３．００ ５，００５，３４３．００
成霖股份 １８，４６９，４０８．００ ３，４７３，９５７．００
达安基因 １７，９５９，７１８．００ ２，０７７，２１８．００