我们对基本药物目录进行了分析，其中独家品种大部分在中药企业，少量在化学药领域。具有独家品种的企业，其产品将面临广阔的全国性市场，特别是对于没有形成全国性覆盖的品种，更加面临良好的前景。大部分化学药品种是众多厂家生产，我们认为目录对于生产普药的企业将会有促进作用，但是受益程度难以估算。
中药企业是本次目录的最大受益者。本次其中云南白药、三九医药、广州药业、中新药业、千金药业、金陵药业、中恒集团、马应龙、美罗药业、太龙药业、同济堂（复星医药）都有独家品种入选。化学药生产商如人福科技的芬太尼（该品种还有常州四药制药生产贴剂，估计销售量较小）、新华制药的葡萄糖酸锑纳也作为独家品种入选。
中药饮片品种也进入了本次基本药物目录，其中，康美药业作为中药饮片的龙头企业，也将会明显受益。
我们认为，对于入选品种收入占公司工业收入比重大的公司未来的业绩弹性会比较大，其中千金药业、天士力、美罗药业、中恒集团、马应龙、金陵药业品种的比重比较大。考虑到天士力的复方丹参滴丸覆盖率比较高了，预期该品种的弹性可能比其他几家公司的小些。
看好具有全国性网络的公司
本次基本药物目录指出，“以省为单位实行网上集中采购、统一配送。由招标选择的药品生产企业、具有现代物流能力的药品经营企业或具备条件的其他企业统一配送。”
我们认为，这将加快流通企业的洗牌进程，也印证了这两年业内流传的“不能进入省前三的医药流通企业将会消亡”的说法。具有全国性网络的国药控股和九州通，以及区域性流通企业（上海医药、南京医药、广州药业等）也将会在本次变革中受益。由于具有全国性网络的流通企业国药控股与九州通在大多数省市已经进入领先行列，意味着国药控股和九州通的全国性网络会更加强大，从中长期看，医药流通企业集中度的提升将会继续提升，由于政策的引导，该领域的集中度提升很有可能快于医药制造领域的集中度提升，我们看好目前已经具有全国性网络的流通企业国药控股，该公司将会是未来的“剩者”。
建议关注估值低、弹性大的入选公司
从基本药物目录投资角度看，我们倾向于挑选弹性较大的公司，如，千金药业、天士力、美罗药业、中恒集团、马应龙、金陵药业等。从估值的角度而言，有品种入选的千金药业、天士力、中恒集团、中新药业、金陵药业、云南白药都是比较低的，因此，我们建议投资者关注。
从投资医药流通领域看，我们建议投资者关注具有全国性网络的国药控股旗下的两架马车国药股份和一致药业。
主要独家品种（单位：亿元）
| 公司 | 品种 | 08销售额 | 08年工业总额 | 比重 |
| 云南白药 | 云南白药（胶囊、膏、酊、气雾剂） | 约6 | 12.62 | 48% |
| 三九医药 | 正天丸（胶囊） | -- | 约23 | -- |
| 三九医药 | 三九胃泰颗粒 | -- | 约23 | -- |
| 广州药业 | 消渴丸 | 4.34 | 18.35 | 24% |
| 广州药业 | 华佗再造丸 | -- | 18.35 | -- |
| 天士力 | 复方丹参片（胶囊、颗粒、滴丸） | 约11.4 | 14.65 | 78% |
| 中新药业 | 速效救心丸 | 3.95 | --- | --- |
| 金陵药业 | 脉络宁 | 5.15 | 1268.24 | 41% |
| 千金药业 | 妇科千金片（胶囊） | 4.35 | 5.47 | 80% |
| 马应龙 | 马应龙麝香痔疮膏 | 1.6 | 3.5 | 46% |
| 太龙药业 | 双黄连合剂 | -- | 2 | --- |
| 同济堂/复星医药 | 仙灵骨葆胶囊 | -- | -- | -- |
| 美罗药业 | 伤科接骨片 | 2.56 | 3.60 | 71% |
| 中恒集团 | 血栓通（冻干） | 2.09 | 3.5 | 60% |
| 人福科技 | 芬太尼 | 1.05 | 6.7 | 16% |
| 新华制药 | 葡萄糖酸锑纳 | --- | 16 | --- |